全球首个!创新AI模型,预测更高效

日前,《科技日报》报道,东南大学教授、东南大学苏州医疗器械研究院院长顾忠泽、东南大学张娟团队创新性地将人类肝脏类器官与人工智能技术结合,开发出全球首个基于肝脏类器官明场图像的AI模型“DILITracer”。该模型通过解析肝脏类器官对30种DILI药物发生反应的3D形态特征,实现对肝毒性药物的较高识别率。相关成果近日刊发于国际学术期刊《Communications Biology》。
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肝脏类器官AI模型助力药物肝毒性分级预测
模式动物在药物性肝损伤(DILI)测试中准确率不高如何破解?记者25日从东南大学获悉,该校教授顾忠泽、张娟团队创新性地将人类肝脏类器官与人工智能技术结合,开发出全球首个基于肝脏类器官明场图像的AI模型“DILITracer”。该模型通过解析肝脏类器官对30种DILI药物发生反应的3D形态特征,实现对肝毒性药物的较高识别率。相关成果近日刊发于国际学术期刊《通讯生物学》。
“药物开发时,DILI是导致临床试验失败和药品退市的主要原因。”论文的共同通讯作者、东南大学教授顾忠泽介绍,此前,人们通常采用模式动物来预测药物诱导性肝损伤,但预测准确率仅43%—63%,而体外模型又多依赖荧光标记或二维细胞系进行预测,存在破坏样本、成本高昂、生理相关性差等缺陷。所以,如何建立可解释、高精度的DILI预测体系,成为药物毒理学研究的重大挑战。
此次研究中,科研团队构建了全球首个能输出DILI三级分类的深度学习模型“DILITracer”。
“我们先采用BEiT-V2视觉编码器,提取类器官图像的3D特征,然后从美国食品药品监督管理局DILIRank数据库中选取了30种引发DILI的药物,并将其分为强肝毒性、弱肝毒性、无肝毒性3个等级,以之诱导人源肝类器官产生不同程度的损伤,并在72小时内,每隔24小时拍摄一次类器官的多角度3D明场图像数据。”论文的第一作者、东南大学公共卫生学院博士生谭诗旖介绍,“类器官的3D明场成像,有点类似于给类器官做了一次CT,可以从不同层面对类器官立体扫描,这就能从多角度了解药物对类器官的作用。”
谭诗旖介绍,随后,团队将类器官特征数据结合时空编码架构,再将明场图像数据集和3个毒性等级的标签投喂给大模型,让大模型根据标签提取图像特征,并最终进行3个毒性等级图像数据的分类。最终,大模型对DILI药物的识别准确率达82.34%,其中非肝毒性药物识别率达90.16%。
顾忠泽表示,该技术突破了动物模型的局限,为药物安全评估提供了无标记、低成本的高通量解决方案。

东南大学苏州医疗器械研究院
该研究院位于江苏医疗器械科技产业园Medpark南区,由东南大学、苏州高新区和江苏省产业技术研究院于2017年合作共建,聚焦药物研发和筛选、个性化医疗、航天医学、生物医用材料、可降解植介入器械等领域,重点开展器官芯片的仿真构建研究与生物信息的精准测量、基于器官芯片的植介入器械评价研究等。
目前,研究院获批建设江苏省新型研发机构、江苏省中小企业公共服务示范平台、江苏省专业化众创空间、苏州市类器官与器官芯片概念验证中心、苏州市生物材料与器官芯片重点实验室、苏州市生物材料与器官芯片创新联合体等。

为加快高端创新资源集聚,Medpark先后引入中国科学院苏州医工所、东南大学苏州医疗器械研究院等国内顶尖科研机构,以及国家智能化医疗器械研究与评价重点实验室等“国字号“平台,以院所平台的技术为“龙头”和“标杆”,推动产学研合作创新,实现成果转化,提升产业创新浓度。
未来,Medpark将继续做好大院大所大平台的支持和精准服务,孵化更多创新企业,推进“创新链、产业链、资金链、人才链”深度融合,营造更具活力的产业创新生态。
来源:科技日报、东南大学苏州医疗器械研究所、苏州高新区发布





